Los permisos se pueden aplicar a las carpetas y controlar así el uso de recursos de un usuario específico. En FAT, hay cuatro permisos diferentes:

• Control total (permiso predeterminado) permite a los usuarios cambiar los permisos de los archivos. Los usuarios también pueden ser propietarios de archivos en volúmenes NFTS y llevar a cabo cualquier tarea que sus permisos autoricen.
• Cambiar permite a los usuarios crear carpetas y añadir archivos, y también modificar y añadir los datos de los archivos. También pueden cambiar los atributos de los archivos, eliminar carpetas y archivos, y realizar cualquier tarea que el permiso Lectura autorice.
• Lectura permite a un usuario ver los nombres de las carpetas y los archivos, ver los datos y los atributos de los archivos, ejecutar archivos de programas y examinar el contenido de las carpetas.
• Sin acceso solo permite a un único usuario conectarse a la carpeta compartida. El acceso a la carpeta está prohibido y sus contenidos no se muestran.

Cada uno de los archivos y carpetas del disco duro tiene asociados unos permisos que establecen qué usuarios pueden leer, escribir y ejecutar los mismos. A continuación aparece un ejemplo del funcionamiento y significado de los permisos para un documento de AppleWorks:

• Lectura (r--)
  Permite abrir el documento AppleWorks si se dispone de permiso de lectura.
• Escritura (-w-)
  Permite guardar cambios en el documento AppleWorks si se dispone de permiso de escritura.
• Ejecución (--x)
  Permite abrir el documento AppleWorks si se dispone de permiso de ejecución. Este permiso sólo es necesario para aplicaciones y archivos ejecutables.

Si el sistema permite realizar los tres tipos de tarea, entonces el usuario dispone de permiso "rwx". Los permisos para carpetas funcionan de modo similar.